Dokumentation Gentechnischer Arbeiten (Formblatt Z) in Gen-Anlage 92/14
If you start lab work, you have to document all S1 lab work in Formblatt Z. Documentation has to be done before you start the lab work!
Please always download the Formblatt Z version provided above and sent the filled Formblatt Z and all additional information about vectors, gene sequences, literature before you start the lab work back to me (Katharina Achazi). The Formblatt Z needs to be filled in German!
More forms and information about genetic engineering and forms you can find on the LAGeSo homepge.
Safety information and risk group assignment of Biological Agents e.g. human materials (such as blood, tissue, plasma or serum), cells, bacteria, viruses and others reagents used in the Biolab is available in the GESTIS Biological Agents Database, the German Collection of Microorganisms and Cell Cultures (DSMZ), the Central Committee on Biological Safety and the Federal Institute for Occupational Safety and Health (BAuA) and information is documented in the AG Haag Wiki in the section BioMaterials, Reagents and Consumables.
Further information on Biosafety you can find here.
Arbeit Nr. Project No | Thema der Arbeit (durchführender Mitarbeiter) Title of the Project (and responsible Person) | Sicherheitsstufe Risk level | Beginn der Arbeiten Start of the Project | Ende der Arbeiten End of the Project | Bemerkungen Comments | Formblatt Z Form Z | Relevante Dokumente Relevant Documents |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
1 | Klonierung, Mutagenese und Expression proteinogener Bindungspartner von polysulfatierten chemischen Polymeren (Katharina Achazi, AG Haag) | 1 | 01.03.2014 | 01.03.2014 | Es gab nur Vorarbeiten und es wurden keine gentechnischen Arbeiten begonnen. Es ist nicht mehr geplant, die Arbeiten zu beginnen. S1-Arbeit Nr. 1 der Gen-Anlage 92/14 gilt daher seit 01.03.2014 als abgeschlossen. | ||
2 | Untersuchung von Interaktionen zwischen Zelllinien und synthetischen (polysulfatierten) Polymeren und Nanopartikeln zur Entwicklung von z.B. Trägersystemen für Medikamente und zukünftigen Arzneimitteln oder Diagnose- bzw. Imagingtools (Katharina Achazi, AG Haag) | 1 | 01.05.2014 | https://wikis.fu-berlin.de/x/wApVT Cell lines to Haag_Jurkats.pdf GIST-Cell-Lines_Email_Versandt.pdf GIST-Cell-Lines_Email_Zellinien.pdf GIST-Cell-Lines_2019.08.07 Formblatt Z CRISPR-PDGFRAmut GIST T1-2.pdf GIST-Cell-Lines_Email_Protokoll.pdf GIST-Cell-Lines_Email_Testung.pdf | |||
3 | Entwicklung von DNA/RNA-Träger- und Transfektionsreagenzien (Stefanie Wedepohl, AG Haag/Calderon/Block/Lauster/ Jan Dürig AG Weng) | 1 | 21.01.2016 | ||||
4 | Testung von antibakteriellen Polymerbeschichtungen (Mingjun Li, AG Haag/Ma) | 1 | 25.10.2016 | ||||
5 | Entwicklung eines zellbasierten Modellsystems zur Untersuchung von Kreuzkontamination fluortensidstabilisierter Flüssigkeitströpfchen, die durch Tröpfchenmikrofluidik erzeugt werden (Suman Chowdhury, AG Haag) | 1 | 25.01.2018 | zu Arbeit 5_pCyL43_Publikation.pdf zu Arbeit 5_Ecoli_NEB strain_specification.pdf zu Arbeit 5_Ecoli_NEB strain_SDS.pdf | |||
6 | Entwicklung von zellbasierten Assays zur funktionellen Überprüfung von modifizierten Liganden von G-Protein gekoppelten Rezeptoren (GPCR). (Stefanie Wedepohl, AG Haag/Calderon/Block/Lauster) | 1 | 13.06.2018 | zu Arbeit 6_pNL nlucP CRE Hygro.pdf | |||
7 | Vaskularisation von 3D-Gewebemodelle mit den HUVEG-GFP Zellen, welche aufgrund des GFP-Gens während des Kultivierungszeitraums mit einem Fluoreszenzmikroskop visualisiert werden können (Laura Elomaa, AG Weinhart) | 1 | 17.02.2020 | zu Arbeit 7_HUVEC-GFP ZKBS.pdf | |||
| 8 | Expression und Aufreinigung von verschiedenen bekannten und anderweitig kommerziell erhältichen Proteinen für die Testung der Aktivität und Interaktion mit Polymeren (Stefanie Wedepohl, AG Haag/Calderon/Block/Lauster) | 1 | 12.12.2018 | zu Arbeit 8_Formblatt_GVO.docx Rabies-und_Vesikuläre_Stomatitis_Viren_rekombinante_2019.pdf Hoffmann2020_Spike-VSV-GFP_ΔG-Luc.pdf Berger-Rentsch_Zimmer2011_VSV-pseudotypes.pdf Hoffmann2010_VSV-GFP_ΔG-Luc.pdf kalhoro2009_pVSV-GFP-G(HA).pdf Fwd_ AW_ [ext] Fwd_ Nutzung des Plasmids S-Protein SARS-CoV-2.pdf VSV pseudotype preparation using HEK-293T cells and FuGene.docx | |||
9 | Untersuchung der Relevanz der Lokalisation spleißosomaler Proteine. (Karen Vester/Bernhard Loll, AG Wahl) | 1 | 01.08.2016 | 23.05.2022 | Alle GVOs wurden am 23.05.2022 in Gen-Anlage 194/10 überführt. S1-Arbeit Nr. 9 der Gen-Anlage 92/14 gilt daher seit 23.05.2022 als abgeschlossen. | ||
| 10 | Testung von antibakteriellen Polymeren (Katharina Achazi, AG Haag) | 1 | 23.02.2021 | zu Arbeit 10_Literatur_ORN-Stämme1.pdf | |||
11 | Expression von Mucinasen zur Charakterisierung von Mucinen (Daniel Lauster/Tatyana Povolotsky, AG Lauster) | 1 | 17.06.2021 | ||||
| 12 | Klonierung und Expression von humanen Proteinen und Proteinmutanten (human MUC5B, MUC5AC, TFF3) für Interaktionsstudien (Daniel Lauster/Robyn Diehn, AG Lauster) | 1 | 03.06.2021 | ||||
| 13 | Expression von viralen Proteinen in Säugerzellen für die Erzeugung von pseudotypisierten, nicht-replikationskompetenten VSV, die für Bindungsstudien verwendet werden (Chuanxiong Nie, AG Haag) | 1 | 19.10.2021 | ||||
| 14 | Biochemische Analyse von Proben von Emx1-Cre;DHPS lox/+ Mäusen bezüglich neuronaler Autophagie und synaptischer Plastizität (Marta Maglione, AG Sigrist) | 1 | 1.7.2022 | DISH TV DOC.pdf FEM_GenDoku Dhps flfl AG Schmitz TVV963 05032020-s.pdf FEM_GenDoku Dhps flfl x Emx1-Cre AG Schmitz TVV963_180621_s.pdf | |||
| 15 | E. coli K12 MG1655 mit tolC-Deletionen, ektopischer Expression von tolC und konstitutiver Expression eines fluoreszierenden Proteins von einem genomischen Lokus, teilweise mit Antibiotikaresistenz. (Hamid Keshmiri in Kollaboration mit AG Block) | 1 | 1.8.2022 | Bakterienstämme wurden fertig aus der BAM übernommen | Biased partitioning of the multidrug efflux pump AcrAB-TolC underlies long-lived phenotypic heterogeneity - SI.pdfBiased partitioning of the multidrug efflux pump AcrAB-TolC underlies long-lived phenotypic heterogeneity.pdfHaldimann, Wanner - 2001 - Conditional-replication, integration, excision, and retrieval plasmid-host systems for gene structure-functio.pdf | ||
| 16 | Mikroskopische Analyse von S1-GVOs (Marta Maglione und Katharina Achazi, Optische Mikroskopie SupraFAB & BioSupraMol) | 1 | 01.12.2022 | Proben werden in anderen Gen-Anlagen vorbereitet und gelagert und in der Gen-Anlage 92/14 nur mikroskopiert. Z-Formulare mit Details sind ind er jeweiligen Gen-Anlage verfügbar (siehe Tabelle) | |||
| 17 | Mikroevolution von Escherichia coli hin zur Verwendung von fluorierten Tryptophan-Analoga (Christin Treiber-Kleinke, AG Koksch) | 1 | 13.12.2022 | Die Arbeiten wurden an der Technischen Universität Berlin (Anlage 424/95) begonnen und werden in Anlage 92/14 weiter geführt | |||
| 18 | Biophysikalische Charakterisierung von Molybdoenzymen mittels Site-directed spin labeling (AG Risse/Schlesinger) | 1 | 9.2.2023 | Die Arbeiten wurden in der Gentechnischen Anlage Nr. 256/11 (Dr. Ramona Schlesinger) begonnen und werden in 92/14 fortgeführt | |||
| 19 | Expression und Einführung nicht natürlicher Aminosäuren in Phytochrome für biophysikalische Untersuchungen (AG Schlesinger) | 1 | 9.2.2023 | Die Arbeiten wurden in der Gentechnischen Anlage Nr. 256/11 (Dr. Ramona Schlesinger) begonnen und werden in 92/14 fortgeführt | |||
| 20 | Klonierung und Expression von verschiedenen TFF3-Konstrukten in E. coli und L. tarentolae (episomal, sekretorisch) im Projekt MucBoost (AG Lauster, Anja Knorrscheidt) | 1 | 01.08.2023 | ||||
| 21 | Herstellung von VLPs zur Testung antiviraler Verbindungen (Chuanxiong Nie, AG Haag / Na Xing, AG Donskyi) | 1 | 03.11.2023 | Addgene CoV2-Spike-EF1a-D614G-N501Y.pdf RNA-Viren _Minigenome,_Replikons_&_virusähnliche Partikel (2021)(2).pdf zu_Arbeit21_VLP_Doudna Science_Rapid Assessment of SARS-CoV-2-evolved.pdf RNA_viruses_minigenomes,replicons&virus-like_particles_2021.pdf FE outgoing MTA Freie Universitat Berlin EN#2936 Jakob Trimpert.pdf | |||
| 22 | Beobachtung der dynamischen Cluster-Bildung von T-Zell-Immun-Signalproteinen während der CAR-vermittelten T-Zell-Aktivierung (Giorgia Carai/ Carmen Rodilla, AG Bottanelli) | 1 | 13.02.2024 | Die Arbeiten wurden in der Gentechnischen Anlage Nr. 383/96 (Dr. Francesca Bottanelli/Helge Ewers) begonnen und die GVOs werden in der Gen-Anlage 92/14 mikroskopiert | |||
| 23 | Mikroskopische Analyse von chimären Proteinen in Arabidopsis thaliana, Nicotiana benthamiana und Cyanidioschyzon merolae (Biswajit, AG Schubert) | 1 | 27.02.2024 | Die Arbeiten wurden in der Gentechnischen Anlage Nr. 570/15 (Prof. Daniel Schubert) begonnen und die GVOs werden in der Gen-Anlage 92/14 mikroskopiert | |||
