Location: Altensteinstr. 23a (SupraFAB), lab 114.4 (Biolab S2 area)
SN: 3869001214
FUB: 72000089200
Responsible persons & booking: https://fub.openiris.io/timeline/fe3ce103-86c0-4aba-a55b-5d7c567aae6b
Detailed information and protocols how to use OpenIris you find here.
Requirements:
Gain permission to work in the Biolabs by follwoing- Watch the video about confocal microscopy.
- Follow theHow-to-Start
- : Biolabs & Optical Microscopy Facility.
- Get an introduction to the device by the responsible person (see above).
- Get access to the BCP-storage network drive suprafab-analytics to save measuremnt data; in addtion, provide (a) User name, (b) ZEDAT account (c) Research lab& (d) Device name to the device responsible person (see above) to get access to the device specific folder.
- Book the device using OpenIRIS (protocls see here).
Manuals
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Zeiss Axio Observer 7 with ApoTome.2
The Zeiss Axio Observer 7 with ApoTome.2 is designed for routine work on fixed or living samples. Optical sectioning can be obtained on fixed samples by using the ApoTome (structured illumination). It is suitable for live cell imaging on fluorescent labeled cells because of the fast switchable Colibri LEDs. The microscope is also capable for brightfield including contrast techniques like phase contrast, DIC and dark-field and has an incubation chamber with CO2.
Suitable for
- Living and fixed samples
- Fluorescence colored samples
- Structured illumination with ApoTome.2, tile or mosaic scans, z-stacks, multicolor imaging, timelapse
- Brightfield Imaging with phase contrast
Microscope Stand
Stand orientation: Inverted
Condenser: LD condenser 0.55 H, Ph1, Ph2, Ph3, DIC, DIC; 6-fold mot.
Microscope Details
Objectives:
- Objective 10x
- Objective Plan-Apochromat 20x/0,8 M27 (a=0,55mm)
- Objective LD LCI Plan-Apochromat 25x/0,8 Imm Korr DIC M27 for water, silicone oil, glycerine or oil immersion, (D=0-0,17mm) (a=0,57mm for D=0,17mm),
- Objective LD LCI Plan-Apochromat 40x/1,2 Imm Korr DIC M27 for water, silicone oil or glycerine immersion; (D=0.15-0.19mm) (a=0.41mm at D=0.17mm)
- Objective Plan-Apochromat 63x/1,4 Oil DIC M27 (a=0,19mm),
XY stage: Table control XY with joystick, Scanning stage with travel range 130 mm x 100 mm, stage surface 325 mm x 144 mm ,max. speed 50 mm/sec, resolution: 0.1 µm, reproducibility: +/- 1 µm, absolute accuracy: +/- 5 µm, Z-PIEZO
Z focus device: motorized Z-drive (max.step size 10 nm) and synchronized image acquisition
Illumination:
- Transmitted light illumination by means of LED
- Incident light illumination using 7-channel LED illumination (solid-state co-light source) to excite Cy7, Cy5, Alexa 631, TOTO-3, mCherry, Alexa 568, mPlum, Cy3, TRITC, DsRed, eGFP, Fluo4, FITC, eCFP, Lucifer Yellow, Alexa 430, DAPI, Alexa 405, Hoechst 33258 and similar dyes.
Fluorescent filter cube: Filter set for CFP, YFP, mCherry, DAPI, FITC, DsRed, Cy5, Cy7 and similar dyes and reflector module for reflex avoidance
Detection: Microscopy camera with sensor type: SONY IMX304 Exmor CMOS SONY Pregius Global Shutter Monochrome, performance min: resolution at 1x1 binning of 4096 x 3008, frame rate frames/23s, readout noise (gain) 2.20 e (1x), full well capacity, 11. 000 e, Dynamic range 1:5000, HDR mode dynamic range 1:25.000, Size / weight: max. 10,8 cm x 7,8 cm x 4,3 cm (2,3" x 3,2" x 1,7") / 580 g, Resistant to high humidity up to min. 80% and between 5-35°C
Computer: Measurement and analysis computer with high memory capacity for system stabilization and image analysis with at least the following parameters: 192 GB RAM, 4 TB hard disk, Intel Xeon Gold 1522 processor, NVIDIA Quadro P4000 8GB DP graphics card
Software: Control and analysis software for multichannel, time-lapse, tile and position, autofocus and Z-stack acquisition, as well as 3D/4D visualization and analysis, densitometric measurements, watershed segmentation, particle counts, and tracking and colocalization analysis
Display: Monitor TFT min. 32"
More information
Incubation: Incubator with temperature control 20-45°C (temperature accuracy: +/- 0.1°C) and CO2 module for 5%CO2
Additional Equpiment:
- 2 slider system for Axio Observer (Optical sectioning using structured illumination)
- Definite Focus (Function against z-Drift)
- Antivibrations-Set
- Experiment Designer,
- Extended Depth of Focus
Manufacturer: Zeiss
Zeiss Axio Observer 7 mit ApoTome.2
Der Zeiss Axio Observer 7 mit ApoTome.2 ist für Routinearbeiten an fixierten oder lebenden Proben konzipiert. Mit dem ApoTome.2 (strukturierte Beleuchtung) können optische Schnitte an fixierten Proben durchgeführt werden. Durch die schnell schaltbaren Colibri-LEDs ist es für die Lebendzellbildgebung an fluoreszenzmarkierten Zellen geeignet. Das Mikroskop ist auch für Hellfeld inklusive Kontrastverfahren wie Phasenkontrast, DIC und Dunkelfeld geeignet und verfügt über eine Inkubationskammer mit CO2.
Geeignet für
- Lebende und fixierte Proben
- Fluoreszenzgefärbte Proben
- Strukturierte Beleuchtung mit ApoTome.2, Kachel- oder Mosaik-Scans, z-Stapel, Multicolor-Imaging, Zeitraffer
- Hellfeld-Imaging mit Phasenkontrast, DIC, dunkelfeld
Mikroskopstativ
Stativausrichtung: invers
Kondensor: LD-Kondensor 0,55 H, Ph1, Ph2, Ph3, DIC, DIC; 6-fach mot.
Mikroskop Details
Objektive:
- Objektiv Plan-Apochromat 20x/0,8 M27 (a=0,55mm)
- Objektiv Plan-Apochromat 63x/1,4 Öl-DIC M27 (a=0,19mm),
- Objektiv LD LCI Plan-Apochromat 25x/0,8 Imm Korr DIC M27 für Wasser, Silikonöl, Glyzerin oder Ölimmersion, (D=0-0,17mm) (a=0,57mm für D=0,17mm),
- Objektiv LD LCI Plan-Apochromat 40x/1,2 Imm Korr DIC M27 für Wasser-, Silikonöl- oder Glyzerin-Immersion; (D=0,15-0,19mm) (a=0,41mm bei D=0,17mm)
XY-Tisch: Tischsteuerung XY mit Joystick, Scanningtisch mit Verfahrbereich 130 mm x 100 mm, Tischfläche 325 mm x 144 mm ,max. Geschwindigkeit 50 mm/sec, Auflösung: 0,1 µm, Reproduzierbarkeit: +/- 1 µm, absolute Genauigkeit: +/- 5 µm, Z-PIEZO
Z-Fokus: motorisierter Z-Trieb (max. Schrittweite 10 nm) und synchronisierter Bildaufnahme
Beleuchtung:
- Durchlicht-Beleuchtung mittels LED
- Auflichtbeleuchtung mittels 7-Kanal-LED-Beleuchtung (Festkörper-Co-Lichtquelle) zur Anregung von Cy7, Cy5, Alexa 631, TOTO-3, mCherry, Alexa 568, mPlum, Cy3, TRITC, DsRed, eGFP, Fluo4, FITC, eCFP, Lucifer Yellow, Alexa 430, DAPI, Alexa 405, Hoechst 33258 und ähnlichen Farbstoffen
Fluoreszenzfilterwürfel: Filtersatz für CFP, YFP, mCherry, DAPI, FITC, DsRed, Cy5, Cy7 und ähnliche Farbstoffe und Reflektormodul zur Reflexvermeidung
Detektionsmikroskopie-Kamera mit Sensortyp: SONY IMX304 Exmor CMOS SONY Pregius Global Shutter Monochrom, Leistung min: Auflösung bei 1x1 Binning von 4096 x 3008, Bildrate Frames/23s, Ausleserauschen (Gain) 2,20 e (1x), Full-Well-Kapazität, 11. 000 e, Dynamikbereich 1:5000, HDR-Modus Dynamikbereich 1:25.000, Größe / Gewicht: max. 10,8 cm x 7,8 cm x 4,3 cm (2,3" x 3,2" x 1,7") / 580 g, Beständig bei hoher Luftfeuchtigkeit bis min. 80% und zwischen 5-35°C
Computer: Mess- und Analyserechner mit hoher Speicherkapazität zur Systemstabilisierung und Bildanalyse mit mindestens folgenden Parametern: 192 GB RAM, 4 TB Festplatte, Intel Xeon Gold 1522 Prozessor, NVIDIA Quadro P4000 8GB DP Grafikkarte
Software: Steuerungs- und Analysesoftware für Mehrkanal-, Zeitraffer-, Kachel- und Positions-, Autofokus- und Z-Stapel-Aufnahme sowie 3D/4D-Visualisierung und -Analyse, densitometrische Messungen, Watershed-Segmentierung, Partikelzählung und Tracking- und Kolokalisationsanalyse
Anzeige: Monitor TFT min. 32"
Mehr Informationen
Inkubation: Inkubator mit Temperaturregelung 20-45°C (Temperaturgenauigkeit: +/- 0,1°C) und CO2-Modul für 5%CO2
Zusatzausstattung:
- 2 Schiebesystem für Axio Observer (Optisches Schneiden mit strukturierter Beleuchtung)
- Definite Focus (Funktion gegen z-Drift)
- Antivibrations-Set
- Experiment-Designer
- Erweiterte Tiefenschärfe
Hersteller: Zeiss